Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEFMP07197 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEFMP07197 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NEFMP07197 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NEFMP07197 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NEFMP07197 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
NEFMP07197 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NEFMP07197 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NEFMP07197 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NEFMP07197 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NEFMP07197 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NEFMP07197 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NEFMP07197 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NEFMP07197 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NEFMP07197 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NEFMP07197 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NEFMP07197 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NEFMP07197 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NEFMP07197 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NEFMP07197 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NEFMP07197 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NEFMP07197 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NEFMP07197 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NEFMP07197 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NEFMP07197 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NEFMP07197 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NEFMP07197 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NEFMP07197 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NEFMP07197 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NEFMP07197 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NEFMP07197 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NEFMP07197 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NEFMP07197 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NEFMP07197 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NEFMP07197 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NEFMP07197 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NEFMP07197 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NEFMP07197 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NEFMP07197 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
NEFMP07197 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
NEFMP07197 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
NEFMP07197 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NEFMP07197 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NEFMP07197 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NEFMP07197 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NEFMP07197 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NEFMP07197 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NEFMP07197 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NEFMP07197 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NEFMP07197 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NEFMP07197 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NEFMP07197 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NEFMP07197 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
NEFMP07197 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NEFMP07197 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NEFMP07197 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NEFMP07197 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NEFMP07197 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NEFMP07197 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NEFMP07197 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NEFMP07197 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NEFMP07197 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NEFMP07197 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEFMP07197 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEFMP07197 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEFMP07197 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEFMP07197 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEFMP07197 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEFMP07197 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NEFMP07197 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEFMP07197 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEFMP07197 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NEFMP07197 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NEFMP07197 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NEFMP07197 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NEFMP07197 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NEFMP07197 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NEFMP07197 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NEFMP07197 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NEFMP07197 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
NEFMP07197 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NEFMP07197 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NEFMP07197 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEFMP07197 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEFMP07197 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEFMP07197 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEFMP07197 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEFMP07197 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
NEFMP07197 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEFMP07197 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEFMP07197 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NEFMP07197 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NEFMP07197 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NEFMP07197 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NEFMP07197 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NEFMP07197 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NEFMP07197 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NEFMP07197 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NEFMP07197 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NEFMP07197 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms