Protein–RNA interactions for Protein: P06732

CKM, Creatine kinase M-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMP06732 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CKMP06732 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CKMP06732 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CKMP06732 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CKMP06732 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CKMP06732 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CKMP06732 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CKMP06732 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CKMP06732 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CKMP06732 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CKMP06732 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CKMP06732 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CKMP06732 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CKMP06732 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CKMP06732 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CKMP06732 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CKMP06732 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CKMP06732 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CKMP06732 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKMP06732 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKMP06732 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKMP06732 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKMP06732 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKMP06732 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKMP06732 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKMP06732 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKMP06732 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKMP06732 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKMP06732 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKMP06732 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKMP06732 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKMP06732 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKMP06732 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CKMP06732 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKMP06732 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKMP06732 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKMP06732 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKMP06732 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKMP06732 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKMP06732 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKMP06732 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CKMP06732 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKMP06732 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKMP06732 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKMP06732 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKMP06732 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CKMP06732 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CKMP06732 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CKMP06732 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CKMP06732 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CKMP06732 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CKMP06732 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CKMP06732 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CKMP06732 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CKMP06732 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKMP06732 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKMP06732 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKMP06732 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKMP06732 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKMP06732 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKMP06732 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKMP06732 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKMP06732 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKMP06732 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKMP06732 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKMP06732 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKMP06732 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKMP06732 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CKMP06732 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKMP06732 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKMP06732 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKMP06732 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKMP06732 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CKMP06732 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKMP06732 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKMP06732 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKMP06732 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKMP06732 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKMP06732 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKMP06732 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKMP06732 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKMP06732 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKMP06732 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKMP06732 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKMP06732 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKMP06732 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKMP06732 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKMP06732 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKMP06732 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKMP06732 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKMP06732 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKMP06732 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKMP06732 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKMP06732 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKMP06732 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKMP06732 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKMP06732 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKMP06732 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKMP06732 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKMP06732 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms