Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
F9P00740 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
F9P00740 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
F9P00740 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
F9P00740 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
F9P00740 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
F9P00740 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
F9P00740 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
F9P00740 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
F9P00740 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
F9P00740 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
F9P00740 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
F9P00740 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
F9P00740 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
F9P00740 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
F9P00740 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
F9P00740 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
F9P00740 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
F9P00740 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
F9P00740 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
F9P00740 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
F9P00740 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
F9P00740 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
F9P00740 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
F9P00740 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
F9P00740 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
F9P00740 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
F9P00740 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
F9P00740 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
F9P00740 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
F9P00740 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
F9P00740 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
F9P00740 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
F9P00740 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
F9P00740 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
F9P00740 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
F9P00740 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
F9P00740 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F9P00740 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F9P00740 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F9P00740 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F9P00740 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
F9P00740 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F9P00740 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F9P00740 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F9P00740 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
F9P00740 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
F9P00740 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
F9P00740 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
F9P00740 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
F9P00740 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
F9P00740 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
F9P00740 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
F9P00740 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
F9P00740 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
F9P00740 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
F9P00740 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
F9P00740 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
F9P00740 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
F9P00740 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F9P00740 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
F9P00740 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
F9P00740 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F9P00740 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F9P00740 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F9P00740 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F9P00740 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
F9P00740 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F9P00740 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F9P00740 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
F9P00740 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
F9P00740 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
F9P00740 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
F9P00740 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
F9P00740 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
F9P00740 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
F9P00740 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
F9P00740 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
F9P00740 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
F9P00740 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
F9P00740 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
F9P00740 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
F9P00740 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
F9P00740 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
F9P00740 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
F9P00740 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
F9P00740 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
F9P00740 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
F9P00740 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
F9P00740 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
F9P00740 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
F9P00740 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
F9P00740 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
F9P00740 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
F9P00740 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
F9P00740 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
F9P00740 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
F9P00740 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
F9P00740 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
F9P00740 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms