Protein–RNA interactions for Protein: O75901

RASSF9, Ras association domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF9O75901 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RASSF9O75901 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RASSF9O75901 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RASSF9O75901 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RASSF9O75901 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RASSF9O75901 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RASSF9O75901 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RASSF9O75901 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RASSF9O75901 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RASSF9O75901 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RASSF9O75901 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RASSF9O75901 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RASSF9O75901 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RASSF9O75901 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RASSF9O75901 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RASSF9O75901 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RASSF9O75901 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RASSF9O75901 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RASSF9O75901 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RASSF9O75901 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RASSF9O75901 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RASSF9O75901 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RASSF9O75901 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RASSF9O75901 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RASSF9O75901 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RASSF9O75901 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RASSF9O75901 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RASSF9O75901 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RASSF9O75901 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RASSF9O75901 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RASSF9O75901 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RASSF9O75901 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RASSF9O75901 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RASSF9O75901 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RASSF9O75901 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RASSF9O75901 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASSF9O75901 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASSF9O75901 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASSF9O75901 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASSF9O75901 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms