Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 NAPA-211ENST00000595826 853 ntTSL 1 (best)16.48■□□□□ 0.236e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 TOM1-215ENST00000491987 852 ntTSL 516.45■□□□□ 0.226e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 MAD1L1-208ENST00000437877 864 ntTSL 216.44■□□□□ 0.226e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 PEX16-204ENST00000525192 903 ntTSL 516.33■□□□□ 0.26e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 SLCO2B1-207ENST00000526660 582 ntTSL 316.2■□□□□ 0.186e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.186e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 PEX16-207ENST00000528674 795 ntTSL 316.14■□□□□ 0.176e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 CCDC18-AS1-217ENST00000449305 748 ntTSL 216.12■□□□□ 0.176e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 NAPA-221ENST00000602082 894 ntTSL 1 (best)16.08■□□□□ 0.166e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.166e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 GNAI2-206ENST00000446079 2086 ntTSL 1 (best)15.78■□□□□ 0.126e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 TTC38-202ENST00000417709 630 ntTSL 315.75■□□□□ 0.116e-10■■■■■ 187.2
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SF3B1O75533 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.096e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.046e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 FKBP11-201ENST00000256680 725 ntTSL 315.27■□□□□ 0.046e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 FKBP11-206ENST00000547789 482 ntTSL 415.27■□□□□ 0.046e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.046e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 PEX16-209ENST00000532554 546 ntTSL 515.19■□□□□ 0.026e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.026e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 SVIL-AS1-201ENST00000413405 767 ntTSL 1 (best)15.11■□□□□ 0.016e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.016e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 USP36-206ENST00000586896 696 ntTSL 515.07■□□□□ 06e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 NAPA-214ENST00000597160 516 ntTSL 1 (best)15.04■□□□□ -06e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 SLC19A1-206ENST00000460174 600 ntTSL 314.89□□□□□ -0.036e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 RALB-205ENST00000447591 558 ntTSL 414.75□□□□□ -0.056e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 FKBP11-213ENST00000553027 4957 nt14.75□□□□□ -0.056e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 PRKD2-208ENST00000597390 1367 ntTSL 1 (best)14.6□□□□□ -0.076e-10■■■■■ 187.2
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SF3B1O75533 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.096e-10■■■■■ 187.2
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SF3B1O75533 RCN1-202ENST00000506388 1658 ntTSL 1 (best)14.29□□□□□ -0.126e-10■■■■■ 187.2
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SF3B1O75533 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.146e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.146e-10■■■■■ 187.2
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SF3B1O75533 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.236e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 USP32-207ENST00000588898 578 ntTSL 513.59□□□□□ -0.236e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 AKAP8-204ENST00000598597 3071 ntTSL 1 (best)13.31□□□□□ -0.286e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 MAK16-201ENST00000360128 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.336e-10■■■■■ 187.2
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SF3B1O75533 GPN3-208ENST00000550974 564 ntTSL 512.66□□□□□ -0.386e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 ADGRV1-222ENST00000639821 893 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.416e-10■■■■■ 187.2
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SF3B1O75533 USP32-202ENST00000393003 1868 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.426e-10■■■■■ 187.2
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SF3B1O75533 CTDSPL-202ENST00000310189 1482 ntTSL 511.96□□□□□ -0.496e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 GALC-209ENST00000555000 2067 ntTSL 211.83□□□□□ -0.526e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 NAPA-222ENST00000602174 643 ntTSL 211.77□□□□□ -0.536e-10■■■■■ 187.2
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SF3B1O75533 RCN1-206ENST00000530348 527 ntTSL 411.32□□□□□ -0.66e-10■■■■■ 187.2
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SF3B1O75533 USP32-211ENST00000590133 2563 ntTSL 211.11□□□□□ -0.636e-10■■■■■ 187.2
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SF3B1O75533 PCCA-208ENST00000458283 669 ntTSL 310.94□□□□□ -0.666e-10■■■■■ 187.2
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SF3B1O75533 ADGRV1-219ENST00000639530 1101 ntTSL 510.78□□□□□ -0.686e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 SMG1-208ENST00000563448 2016 ntTSL 210.76□□□□□ -0.696e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 TOP3A-211ENST00000581536 766 ntTSL 510.58□□□□□ -0.726e-10■■■■■ 187.2
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SF3B1O75533 SVIL-AS1-207ENST00000445521 188 ntTSL 410.33□□□□□ -0.766e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 PRKCH-215ENST00000555382 691 ntTSL 310.29□□□□□ -0.766e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 ADGRV1-216ENST00000639212 1167 ntTSL 510.26□□□□□ -0.776e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 NAPA-213ENST00000597118 553 ntTSL 410.21□□□□□ -0.786e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 PRKCH-218ENST00000555628 569 ntTSL 410.13□□□□□ -0.796e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 PRKCH-208ENST00000553846 557 ntTSL 410.13□□□□□ -0.796e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 PRKCH-211ENST00000555082 2932 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.796e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 CCDC18-AS1-214ENST00000445076 620 ntTSL 210.06□□□□□ -0.86e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 GALNTL6-203ENST00000506823 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.86e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 INSR-202ENST00000341500 8954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.816e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 AC098613.1-201ENST00000451485 656 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.826e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 NAPA-208ENST00000594288 562 ntTSL 49.8□□□□□ -0.846e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 NKAPP1-202ENST00000536487 596 ntTSL 39.79□□□□□ -0.846e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 NADSYN1-204ENST00000525200 3616 ntTSL 29.75□□□□□ -0.856e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 SLCO2B1-215ENST00000531713 578 ntTSL 39.68□□□□□ -0.866e-10■■■■■ 187.2
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SF3B1O75533 FKBP11-209ENST00000551094 517 ntTSL 29.31□□□□□ -0.926e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 GIN1-201ENST00000399004 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.956e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 GNAI2-211ENST00000491100 3886 ntTSL 29.06□□□□□ -0.966e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 FKBP11-205ENST00000546847 524 ntTSL 38.79□□□□□ -16e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 GPN3-207ENST00000550228 353 ntTSL 38.68□□□□□ -1.026e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 GALC-205ENST00000477716 605 ntTSL 48.53□□□□□ -1.046e-10■■■■■ 187.2
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 289.4 ms