Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EDIL3O43854 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EDIL3O43854 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
EDIL3O43854 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
EDIL3O43854 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EDIL3O43854 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EDIL3O43854 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EDIL3O43854 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EDIL3O43854 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EDIL3O43854 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EDIL3O43854 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EDIL3O43854 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EDIL3O43854 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EDIL3O43854 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EDIL3O43854 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EDIL3O43854 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EDIL3O43854 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EDIL3O43854 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EDIL3O43854 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EDIL3O43854 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EDIL3O43854 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EDIL3O43854 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EDIL3O43854 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EDIL3O43854 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EDIL3O43854 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EDIL3O43854 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EDIL3O43854 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EDIL3O43854 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EDIL3O43854 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EDIL3O43854 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EDIL3O43854 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EDIL3O43854 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
EDIL3O43854 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EDIL3O43854 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EDIL3O43854 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EDIL3O43854 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EDIL3O43854 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EDIL3O43854 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EDIL3O43854 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EDIL3O43854 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EDIL3O43854 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EDIL3O43854 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EDIL3O43854 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EDIL3O43854 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EDIL3O43854 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
EDIL3O43854 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
EDIL3O43854 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EDIL3O43854 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EDIL3O43854 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EDIL3O43854 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EDIL3O43854 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
EDIL3O43854 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EDIL3O43854 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EDIL3O43854 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EDIL3O43854 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EDIL3O43854 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms