Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF14O43557 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms