Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KCNQ3O43525 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KCNQ3O43525 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KCNQ3O43525 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KCNQ3O43525 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KCNQ3O43525 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KCNQ3O43525 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KCNQ3O43525 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KCNQ3O43525 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KCNQ3O43525 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
KCNQ3O43525 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KCNQ3O43525 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KCNQ3O43525 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KCNQ3O43525 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KCNQ3O43525 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KCNQ3O43525 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KCNQ3O43525 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KCNQ3O43525 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KCNQ3O43525 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KCNQ3O43525 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KCNQ3O43525 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
KCNQ3O43525 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
KCNQ3O43525 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
KCNQ3O43525 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
KCNQ3O43525 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KCNQ3O43525 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KCNQ3O43525 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KCNQ3O43525 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KCNQ3O43525 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KCNQ3O43525 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KCNQ3O43525 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KCNQ3O43525 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KCNQ3O43525 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KCNQ3O43525 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KCNQ3O43525 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KCNQ3O43525 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KCNQ3O43525 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
KCNQ3O43525 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KCNQ3O43525 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KCNQ3O43525 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KCNQ3O43525 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KCNQ3O43525 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KCNQ3O43525 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KCNQ3O43525 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KCNQ3O43525 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KCNQ3O43525 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KCNQ3O43525 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KCNQ3O43525 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KCNQ3O43525 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KCNQ3O43525 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KCNQ3O43525 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KCNQ3O43525 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KCNQ3O43525 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KCNQ3O43525 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KCNQ3O43525 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KCNQ3O43525 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KCNQ3O43525 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KCNQ3O43525 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KCNQ3O43525 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KCNQ3O43525 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KCNQ3O43525 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KCNQ3O43525 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KCNQ3O43525 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KCNQ3O43525 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KCNQ3O43525 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KCNQ3O43525 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KCNQ3O43525 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KCNQ3O43525 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KCNQ3O43525 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KCNQ3O43525 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KCNQ3O43525 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KCNQ3O43525 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KCNQ3O43525 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KCNQ3O43525 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms