Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARPC5O15511 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARPC5O15511 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ARPC5O15511 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
ARPC5O15511 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARPC5O15511 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARPC5O15511 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARPC5O15511 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARPC5O15511 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARPC5O15511 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARPC5O15511 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARPC5O15511 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARPC5O15511 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARPC5O15511 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARPC5O15511 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARPC5O15511 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARPC5O15511 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARPC5O15511 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.5 ms