Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EBAG9O00559 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms