Protein–RNA interactions for Protein: O00399

DCTN6, Dynactin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN6O00399 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCTN6O00399 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DCTN6O00399 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DCTN6O00399 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DCTN6O00399 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DCTN6O00399 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCTN6O00399 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCTN6O00399 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCTN6O00399 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCTN6O00399 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCTN6O00399 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCTN6O00399 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCTN6O00399 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DCTN6O00399 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCTN6O00399 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCTN6O00399 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCTN6O00399 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCTN6O00399 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DCTN6O00399 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCTN6O00399 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCTN6O00399 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCTN6O00399 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCTN6O00399 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCTN6O00399 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCTN6O00399 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCTN6O00399 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCTN6O00399 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCTN6O00399 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCTN6O00399 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCTN6O00399 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCTN6O00399 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCTN6O00399 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCTN6O00399 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCTN6O00399 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCTN6O00399 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCTN6O00399 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms