Protein–RNA interactions for Protein: O00232

PSMD12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD12O00232 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PSMD12O00232 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD12O00232 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD12O00232 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD12O00232 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD12O00232 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD12O00232 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD12O00232 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD12O00232 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD12O00232 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD12O00232 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD12O00232 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD12O00232 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD12O00232 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PSMD12O00232 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD12O00232 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PSMD12O00232 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD12O00232 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD12O00232 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD12O00232 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD12O00232 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD12O00232 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD12O00232 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PSMD12O00232 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD12O00232 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD12O00232 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD12O00232 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD12O00232 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms