Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBXN8O00124 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN8O00124 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms