Protein–RNA interactions for Protein: A6XGL0

YJEFN3, YjeF N-terminal domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YJEFN3A6XGL0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
YJEFN3A6XGL0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
YJEFN3A6XGL0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms