Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC160A6NGH7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms