Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQS6

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQS6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RQS6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RQS6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RQS6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RQS6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RQS6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RQS6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RQS6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RQS6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
A0A0U1RQS6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A0A0U1RQS6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms