Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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PPARGC1AQ9UBK2 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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PPARGC1AQ9UBK2 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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PPARGC1AQ9UBK2 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PPARGC1AQ9UBK2 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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