Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMG20BQ9P0W2 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms