Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CNPPD1Q9BV87 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms