Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms