Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
GCSAMQ8N6F7 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
GCSAMQ8N6F7 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms