Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD4P46934 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD4P46934 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD4P46934 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD4P46934 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD4P46934 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD4P46934 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD4P46934 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD4P46934 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD4P46934 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD4P46934 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD4P46934 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD4P46934 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD4P46934 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD4P46934 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD4P46934 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD4P46934 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD4P46934 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD4P46934 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD4P46934 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD4P46934 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD4P46934 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD4P46934 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD4P46934 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD4P46934 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD4P46934 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD4P46934 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD4P46934 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD4P46934 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD4P46934 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD4P46934 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD4P46934 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD4P46934 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms