Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP8P40818 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP8P40818 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP8P40818 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP8P40818 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP8P40818 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP8P40818 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP8P40818 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP8P40818 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP8P40818 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP8P40818 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP8P40818 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP8P40818 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP8P40818 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP8P40818 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP8P40818 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP8P40818 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP8P40818 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP8P40818 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP8P40818 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP8P40818 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP8P40818 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP8P40818 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP8P40818 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP8P40818 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP8P40818 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP8P40818 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP8P40818 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
USP8P40818 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP8P40818 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
USP8P40818 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP8P40818 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP8P40818 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
USP8P40818 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
USP8P40818 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
USP8P40818 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP8P40818 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
USP8P40818 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
USP8P40818 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP8P40818 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP8P40818 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP8P40818 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP8P40818 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP8P40818 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms