Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CREB3O43889 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CREB3O43889 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CREB3O43889 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CREB3O43889 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CREB3O43889 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CREB3O43889 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CREB3O43889 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CREB3O43889 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CREB3O43889 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CREB3O43889 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CREB3O43889 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CREB3O43889 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CREB3O43889 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CREB3O43889 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CREB3O43889 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CREB3O43889 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CREB3O43889 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CREB3O43889 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CREB3O43889 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CREB3O43889 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CREB3O43889 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CREB3O43889 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CREB3O43889 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CREB3O43889 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CREB3O43889 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CREB3O43889 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CREB3O43889 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CREB3O43889 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CREB3O43889 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CREB3O43889 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CREB3O43889 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CREB3O43889 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CREB3O43889 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CREB3O43889 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CREB3O43889 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CREB3O43889 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CREB3O43889 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CREB3O43889 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CREB3O43889 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CREB3O43889 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CREB3O43889 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CREB3O43889 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CREB3O43889 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CREB3O43889 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CREB3O43889 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CREB3O43889 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CREB3O43889 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CREB3O43889 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CREB3O43889 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CREB3O43889 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CREB3O43889 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CREB3O43889 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CREB3O43889 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CREB3O43889 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CREB3O43889 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CREB3O43889 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CREB3O43889 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CREB3O43889 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CREB3O43889 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CREB3O43889 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CREB3O43889 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CREB3O43889 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CREB3O43889 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CREB3O43889 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CREB3O43889 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CREB3O43889 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CREB3O43889 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms