Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MCF2LO15068 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
MCF2LO15068 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MCF2LO15068 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MCF2LO15068 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MCF2LO15068 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCF2LO15068 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MCF2LO15068 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCF2LO15068 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MCF2LO15068 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCF2LO15068 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MCF2LO15068 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCF2LO15068 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCF2LO15068 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCF2LO15068 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MCF2LO15068 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCF2LO15068 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MCF2LO15068 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCF2LO15068 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCF2LO15068 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCF2LO15068 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCF2LO15068 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MCF2LO15068 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCF2LO15068 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MCF2LO15068 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MCF2LO15068 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MCF2LO15068 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MCF2LO15068 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCF2LO15068 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
MCF2LO15068 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MCF2LO15068 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MCF2LO15068 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MCF2LO15068 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MCF2LO15068 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MCF2LO15068 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MCF2LO15068 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MCF2LO15068 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MCF2LO15068 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MCF2LO15068 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MCF2LO15068 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MCF2LO15068 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MCF2LO15068 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCF2LO15068 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCF2LO15068 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCF2LO15068 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
MCF2LO15068 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCF2LO15068 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCF2LO15068 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MCF2LO15068 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms