Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 CPPED1-202ENST00000381774 6273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 MADD-204ENST00000395336 5942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDHGA12-201ENST00000252085 4747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 ITGAX-201ENST00000268296 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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ARL2-SNX15V9GYD0 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXO22-201ENST00000308275 10725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 GEMIN5-201ENST00000285873 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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ARL2-SNX15V9GYD0 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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ARL2-SNX15V9GYD0 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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ARL2-SNX15V9GYD0 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM164-204ENST00000372073 5567 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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ARL2-SNX15V9GYD0 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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ARL2-SNX15V9GYD0 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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ARL2-SNX15V9GYD0 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
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ARL2-SNX15V9GYD0 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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ARL2-SNX15V9GYD0 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 DENND4C-205ENST00000434457 6718 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 WSCD2-201ENST00000332082 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 SEMA6A-202ENST00000343348 6878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 SYNRG-229ENST00000621136 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 STRN-201ENST00000263918 8168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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