Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X0

DPM3, Dolichol-phosphate mannosyltransferase subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPM3Q9P2X0 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DPM3Q9P2X0 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms