Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA3Q8TBC4 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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