Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEJ0

DUSP18, Dual specificity protein phosphatase 18, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP18Q8NEJ0 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 GLO1-201ENST00000373365 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 PDZRN3-205ENST00000466780 2737 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 ITFG2-201ENST00000228799 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 USB1-207ENST00000563149 1751 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 LINC01428-201ENST00000449581 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
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DUSP18Q8NEJ0 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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DUSP18Q8NEJ0 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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DUSP18Q8NEJ0 GALNT15-203ENST00000437509 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 CYP24A1-203ENST00000395955 2227 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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