Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms