Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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