Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EP300Q09472 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EP300Q09472 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EP300Q09472 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EP300Q09472 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EP300Q09472 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EP300Q09472 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EP300Q09472 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EP300Q09472 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EP300Q09472 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EP300Q09472 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EP300Q09472 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EP300Q09472 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EP300Q09472 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EP300Q09472 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EP300Q09472 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EP300Q09472 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EP300Q09472 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EP300Q09472 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EP300Q09472 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EP300Q09472 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EP300Q09472 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EP300Q09472 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
EP300Q09472 AC106789.1-201ENST00000512927 570 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EP300Q09472 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EP300Q09472 AL031768.1-201ENST00000606542 701 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
EP300Q09472 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EP300Q09472 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EP300Q09472 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EP300Q09472 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EP300Q09472 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EP300Q09472 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EP300Q09472 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EP300Q09472 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EP300Q09472 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EP300Q09472 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EP300Q09472 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EP300Q09472 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EP300Q09472 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EP300Q09472 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 MIR193A-201ENST00000384882 88 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 AP002856.3-201ENST00000441665 635 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 MIR5193-201ENST00000584510 109 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 AC134878.2-201ENST00000620700 1265 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 U3.41-201ENST00000408711 219 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 AC091729.3-203ENST00000413706 674 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EP300Q09472 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms