Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms