Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLA-EP13747 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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