Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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