Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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C4orf47A7E2U8 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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C4orf47A7E2U8 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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C4orf47A7E2U8 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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C4orf47A7E2U8 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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C4orf47A7E2U8 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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C4orf47A7E2U8 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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C4orf47A7E2U8 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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