Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 BRWD1-204ENST00000380800 7605 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 ADNP-203ENST00000396029 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms