Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HPGDP15428 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HPGDP15428 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HPGDP15428 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HPGDP15428 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HPGDP15428 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HPGDP15428 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HPGDP15428 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HPGDP15428 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HPGDP15428 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HPGDP15428 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HPGDP15428 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HPGDP15428 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HPGDP15428 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HPGDP15428 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HPGDP15428 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HPGDP15428 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HPGDP15428 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HPGDP15428 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HPGDP15428 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HPGDP15428 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HPGDP15428 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HPGDP15428 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HPGDP15428 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HPGDP15428 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HPGDP15428 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HPGDP15428 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HPGDP15428 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HPGDP15428 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HPGDP15428 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HPGDP15428 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HPGDP15428 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HPGDP15428 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HPGDP15428 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HPGDP15428 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HPGDP15428 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HPGDP15428 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HPGDP15428 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HPGDP15428 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HPGDP15428 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HPGDP15428 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HPGDP15428 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HPGDP15428 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HPGDP15428 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HPGDP15428 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HPGDP15428 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HPGDP15428 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HPGDP15428 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HPGDP15428 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HPGDP15428 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HPGDP15428 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HPGDP15428 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HPGDP15428 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HPGDP15428 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HPGDP15428 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HPGDP15428 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HPGDP15428 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HPGDP15428 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HPGDP15428 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HPGDP15428 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HPGDP15428 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HPGDP15428 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HPGDP15428 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HPGDP15428 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HPGDP15428 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HPGDP15428 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HPGDP15428 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HPGDP15428 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HPGDP15428 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HPGDP15428 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HPGDP15428 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HPGDP15428 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HPGDP15428 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HPGDP15428 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HPGDP15428 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HPGDP15428 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HPGDP15428 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HPGDP15428 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HPGDP15428 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HPGDP15428 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HPGDP15428 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HPGDP15428 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HPGDP15428 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HPGDP15428 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HPGDP15428 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HPGDP15428 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HPGDP15428 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HPGDP15428 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HPGDP15428 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HPGDP15428 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HPGDP15428 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HPGDP15428 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HPGDP15428 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HPGDP15428 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HPGDP15428 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HPGDP15428 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HPGDP15428 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HPGDP15428 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HPGDP15428 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HPGDP15428 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms