Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 GMEB2-201ENST00000266068 4559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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ARL2-SNX15V9GYD0 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 NPAP1-201ENST00000329468 7526 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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ARL2-SNX15V9GYD0 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 COX18-201ENST00000295890 6846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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ARL2-SNX15V9GYD0 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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ARL2-SNX15V9GYD0 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
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ARL2-SNX15V9GYD0 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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ARL2-SNX15V9GYD0 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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ARL2-SNX15V9GYD0 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAMTS9-210ENST00000498707 7624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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ARL2-SNX15V9GYD0 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 TBL1X-206ENST00000424279 5451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFC3H1-201ENST00000378743 7285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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