Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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TMED7Q9Y3B3 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
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TMED7Q9Y3B3 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMED7Q9Y3B3 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMED7Q9Y3B3 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMED7Q9Y3B3 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMED7Q9Y3B3 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMED7Q9Y3B3 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMED7Q9Y3B3 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMED7Q9Y3B3 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMED7Q9Y3B3 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMED7Q9Y3B3 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMED7Q9Y3B3 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMED7Q9Y3B3 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMED7Q9Y3B3 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMED7Q9Y3B3 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMED7Q9Y3B3 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMED7Q9Y3B3 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMED7Q9Y3B3 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMED7Q9Y3B3 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMED7Q9Y3B3 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TMED7Q9Y3B3 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMED7Q9Y3B3 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMED7Q9Y3B3 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMED7Q9Y3B3 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TMED7Q9Y3B3 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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