Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIT1Q9Y2X7 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 284.1 ms