Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms