Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CA9Q16790 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CA9Q16790 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CA9Q16790 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CA9Q16790 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CA9Q16790 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CA9Q16790 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CA9Q16790 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CA9Q16790 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CA9Q16790 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CA9Q16790 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CA9Q16790 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CA9Q16790 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CA9Q16790 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CA9Q16790 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CA9Q16790 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CA9Q16790 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CA9Q16790 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CA9Q16790 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CA9Q16790 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CA9Q16790 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CA9Q16790 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CA9Q16790 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CA9Q16790 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CA9Q16790 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CA9Q16790 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CA9Q16790 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CA9Q16790 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CA9Q16790 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CA9Q16790 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CA9Q16790 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CA9Q16790 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CA9Q16790 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CA9Q16790 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CA9Q16790 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CA9Q16790 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CA9Q16790 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CA9Q16790 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CA9Q16790 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CA9Q16790 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CA9Q16790 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CA9Q16790 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CA9Q16790 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CA9Q16790 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CA9Q16790 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CA9Q16790 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CA9Q16790 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CA9Q16790 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms