Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC11□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC11□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms