Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 AC006001.3-201ENST00000449307 7092 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TSTA3Q13630 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms