Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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SFTPCP11686 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 PLSCR4-203ENST00000433593 2839 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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