Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNIH4Q9P003 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms