Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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