Protein–RNA interactions for Protein: Q96P50

ACAP3, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP3Q96P50 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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