Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms